В статье рассмотрена методика оценки эффективности региональной кластерной стратегии, с учетом дополненной автором финансовой составляющей. В данном процессе рассмотрены вопросы кластеров, структуры и их классификаций; для этого проведен анализ таких понятий, как: кластер, производственный кластер, региональная экономическая кластерная стратегия и её составляющие; сформулирован перечень мер и программ, стимулирующих увеличение финансовых потоков, предложена дополненная методика оценки эффективности региональной экономической кластерной стратегии на этапе кластеризации. Оценка эффективности стратегий проведена по региональным инновационным производственным кластерам, расположенным в разных крупных экономических районах России, в частности, в Республике Башкортостан, Свердловской области и на Дальнем Востоке. Несмотря на практически одинаковый период создания, доказано, что они находятся на разных этапах жизненного цикла, что значительно влияет на структуру финансовых потоков. Специализация кластеров обусловлена наличием разнородного природно-экономического потенциала регионов, обусловившего проявление уникальных отраслевых особенностей, которые также влияют на финансовое состояние кластера и на его главный элемент – ядро. В работе рассматривались только те кластеры, управленческую структуру которых можно представить по концептуальной модели устройства кластеров «Жемчужина», разработанной руководством Европейского союза. Данная модель наиболее полно отражает тенденции в области управления кластерами и организации их финансового менеджмента. Выводы, полученные в результате данного анализа, отображают закономерности развития кластера и его влияние на финансово-экономическое состояние региона. Достоверность подтверждена данными ретроспективного анализа до момента кластеризации, в момент кластеризации и через три года с момента образования кластеров.